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La bibliothèque de la Faculté de Medecine de Pharmacie et d'Odonto-Stomatologie a été créée en 1969 en même temps que l'école de Médecine. Le batiment qu'elle occupe actuellement a été construit en 1987 par la coopération française.

Située dans l'enceinte de la FMPOS, la   bibliothèque comprend une salle de lecture de 50 places assisses, 2 bureaux pour le personnel, un magasin, une salle de réprographie, une toilette.

La lecture des documents de la bibliohtèque se fait sur place. Le prêt à domicile n'est accordé qu'aux étudiants de la Faculté en cours de rédaction de leur thèses.

La bibliothèque a accès à internet grâce au  Malaria Research and Training Center (MRTC). Elle utilise le logiciel documentaire CDS/ISIS pour la gestion de sa base de données bibliographique. Elle utilise la classification décimale universelle pour la classifaication des ouvrages. Les thèses sont classées par année et par ordre séquentiel à l'intérieur de chaque annéé. Elle publie une revue bibliographique trimestrielle “Digest Santé Mali” financée par la Dreyfus Health fondation.